Ένα στα τρία θετικά με «όμικρον» στη Στερεά. Το πρώτο επίσημο κρούσμα της νέας μετάλλαξης στην Ευρυτανία…

Δόθηκαν στη δημοσιότητα τα στοιχεία από το Eθνικό Δίκτυο Γονιδιωματικής Επιτήρησης του ιού SARS-CoV-2, για την ανάλυση 1.007 δειγμάτων μέχρι τις 3 Ιανουαρίου 2022.

Από αυτά τα 976 αποδείχθηκαν δείγματα με στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος και μάλιστα τα 625 αφορούν στο στέλεχος Delta, και 351 αφορούν στο Omicron (35,96%).

Επισημαίνεται ωστόσο ότι υπάρχει μέσα ικανό διάστημα όπου η μετάλλαξη Delta, ήταν σχεδόν αποκλειστική στη χώρα μας και καλύτερη εικόνα θα υπάρχει όταν ενσωματωθούν περισσότερα δείγματα από τις 28/12 όπου η Omicron ξεκινά να ανιχνεύεται σε ποσοστό άνω του 50%.

Προς το παρόν με βάση τα στοιχεία των εβδομάδων αναφοράς έως 2/1/2022 (εβδομάδες 51-52), η Omicron φτάνει το 45,37%.

Όσον αφορά τη Στερεά Ελλάδα, η συμμετοχή της στα ανωτέρω δείγματα ήταν στα 83 δείγματα, με τα 29 από αυτά με στέλεχος Omicron (34,94%) και 54 με Delta.

Ειδικότερα, 18 βρέθηκαν στη Βοιωτία (48,65% με ακόμη 19 δείγματα Delta), 9 στην Εύβοια (31,03% με ακόμη 20 δείγματα Delta), 1 στην Ευρυτανία (100%) και 1 στη Φθιώτιδα (7,69% με ακόμη 12 δείγματα Delta).

Δείτε παρακάτω το σύνολο με τον απόλυτο αριθμό κρουσμάτων σε Delta - Omicron (έως 2/1/22):

Βοιωτία 361 - 21

Εύβοια 322 - 13

Ευρυτανία 48 - 1

Φθιώτιδα  138 - 3

Φωκίδα 60 - 0

Το γονίδιο Spike

Η παραλλαγή Omicron (B.1.1.529/BA.1) χαρακτηρίζεται από την παρουσία μιας διαγραφής νουκλεοτιδίων, της διαγραφής 69-70 (del69-70) στο γονίδιο S (Spike) του ιού. Η διαγραφή αυτή έχει ως αποτέλεσμα την αδυναμία ενίσχυσης ενός εκ των τριών γονιδιακών στόχων, του γονιδίου S, σε συγκεκριμένη εμπορικά διαθέσιμη διαγνωστική δοκιμασία μοριακού ελέγχου (RT-PCR), που εφαρμόζεται σε ορισμένα εργαστήρια στη χώρα μας και ευρύτερα παγκοσμίως. Επιπλέον, προκαταρκτικός έλεγχος για πιθανά κρούσματα του στελέχους Όμικρον, πραγματοποιείται και με εναλλακτικά πρωτόκολλα μοριακού ελέγχου (RT-PCR), που στοχεύουν στην ύπαρξη συγκεκριμένων μεταλλάξεων σε διαφορετικές περιοχές του γονιδίου S, οι οποίες είναι ειδικές για το στέλεχος Όμικρον.

Θετικά δείγματα που έχουν ελεγχθεί με τα συγκεκριμένα πρωτόκολλα μοριακής διάγνωσης και χαρακτηρίζονται από αδυναμία ενίσχυσης του γονιδίου S, εγείρουν ισχυρή υποψία ότι πρόκειται για πιθανά κρούσματα του στελέχους Όμικρον (B.1.1.529/BA.1) στην παρούσα φάση της πανδημίας.

Η αξιολόγηση του συγκεκριμένου μοριακού ευρήματος κατά τον μοριακό έλεγχο (αδυναμία ενίσχυσης του γονιδίου S) επιτρέπει μια προκαταρκτική εκτίμηση σε πραγματικό χρόνο της επίπτωσης της Όμικρον (B.1.1.529/BA.1) στο σύνολο των θετικών μοριακών ελέγχων. Η ακριβής εκτίμηση της επίπτωσης της Όμικρον μπορεί να γίνει μόνον με την αλληλούχιση του πλήρους γονιδιώματος του ιού από αντιπροσωπευτικά θετικά δείγματα (γονιδιωματική επιτήρηση).

Δείτε δύο διαγράμματα με τα δείγματα που παρουσίασαν αδυναμία ενίσχυσης του γονιδίου S, στο πρώτο έφτασαν τα 9.449 σε σύνολο 15.065 και στο δεύτερο τα 13.685 σε σύνολο θετικών μοριακών ελέγχων 20.753:

Στοιχεία από τα παρακάτω εργαστήρια:

1. Εργαστήριο Κλινικής Ιολογίας Κρήτης Ιατρικής Σχολής Πανεπιστημίου Κρήτης

2. Εργαστήριο Υγιεινής και Επιδημιολογίας Πανεπιστημίου Θεσσαλίας

3. Εργαστήριο Μικροβιολογίας, Ιατρική Σχολή, ΑΠΘ

4. Κεντρικό Εργαστήριο Δημόσιας Υγείας, ΕΟΔΥ

5. Ίδρυμα Ιατροβιολογικών Ερευνών Ακαδημίας Αθηνών (ΙΙΒΕΑΑ)

6. Εργαστήριο Μοριακής Διάγνωσης Λοιμογόνων Παραγόντων, Τμήμα Ιατρικής, Παν/ο Πατρών